ARTICULO CIENTIFICO POR LISBETH LOPEZ

SE RESUELVE ROMPECABEZA DEL ESCHERICHIA COLI

Teniendo en cuenta  las  investigaciones  realizadas  por un grupo de investigadores del Instituto Craig Venter, la Universidad de Virginia y el Instituto de Investigación Biomédica (IRB) sobre la escherichia coli ,  los cuales han presentado  el primer mapa  de las interacciones claves entre las piezas moleculares de esta bacteria, a través del cual se ha permitido entender cómo funciona íntimamente su estructura , y que ala vez se  ha logra establecer cómo trabaja esta bacteria , revelando así cerca del 25 %  (2.234) de las aproximadamente 10.000 interacciones clave estimadas que se dan en E. coli, y cubre aproximadamente el 70% de su proteoma (la colección de proteínas).

E. coli es la bacteria más usada en biotecnología blanca, es decir, para producir grandes cantidades de material químico, como la artemisia para tratar la malaria o la insulina para la diabetes.

se conoce extensivamente la genómica –hay decenas de cepas secuenciadas, desde algunas patológicas a otras que no lo son– y la proteínica de complejos (mapa de los complejos de proteínas). Además, es el organismo modelo donde se han hecho más estudios de metabólica (el mapa de los ciclos metabólicos).

Gracias a la información obtenida de estos estudios -omicos a gran escala ha permitido obtener el listado de los elementos moleculares de E. coli que intervienen en su funcionamiento. Pero para tener el plano total del ser vivo, de cómo trabaja y funciona, debía encararse el interactoma, es decir, las interacciones moleculares entre todos los elementos descritos y, en concreto, entre proteínas

Patrick aloy, uno de los autores del trabajo. “El mapa presentado nos permite ver la bacteria íntimamente y diseñar, por ejemplo, antibióticos para romper interacciones entre proteínas o desmantelar partes de su maquinaria molecular, o simplemente entender cómo funciona en toda su complejidad. Este trabajo nos ayuda a comprender cómo funcionan las redes que constituyen y regulan las funciones vitales de E. coli".

En la última parte de este estudio se ha ha podido confirmar “lo que ya se sospechaba”, explica Aloy, como que la bacteria E. coli es un buen organismo modelo y las conclusiones son extrapolables a muchas otras bacterias, ya que este estudio incluye una comparativa con los proteomas de 20 bacterias, muchas de las cuales son causantes de patologías severas, como las producidas por Helicobacter pylori, Vibrio cholera, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitides y Yersinia pestis , ya que se aporta  información útil para usos biotecnológicos, para entender patología y para diseñar drogas”, concluye el investigador del IRB Barcelona, quien mantiene diversos proyectos de colaboración con el Instituto Craig Venter.

Donde se hacen nuevo diseño de fármacos para luchar contra las infecciones era el objetivo principal de estos estudios sobre la estructura molecular de esta bacteria.

La cual habita en el intestino. La mayoría de las E. coli no causan problemas. Pero, algunos tipos pueden producir enfermedades y causar diarrea. Uno de ellos causa la diarrea del viajero. El peor tipo de E. coli causa una diarrea hemorrágica y a veces puede causar insuficiencia renal y hasta la muerte. Esto, en general, ocurre en niños y en adultos con sistemas inmunitarios debilitados.

Pero hoy gracias a este gran avance se lograrán tener un mayor control de esta y de muchas más bacterias que tienen similitud en su estructura, permitiendo así crear tratamientos efectivos contra algunas bacterias causantes de enfermedades que atacan severamente los sistemas inmunológicos.

Referencia bibliográfica

Nature Biotecnologyc’

 THE BREAKING OF ESCHERICHIA COLI IS RESOLVED

Taking into account research conducted by a group of researchers from the Craig Venter Institute, the University of Virginia and the Institute of Biomedical Research (IRB) on escherichia coli, who have presented the first map of key interactions between molecular pieces of This bacterium, through which it has been possible to understand how its structure functions intimately, and that at the same time it has been possible to establish how this bacterium works, thus revealing about 25% (2,234) of the approximately 10.000 estimated key interactions occurring in E. coli, and covers about 70% of its proteome (the collection of proteins). E. coli is the most commonly used bacterium in white biotechnology, ie to produce large amounts of chemicol material, such as artemisia to treat malaria or insulin for diabetes.

Genomics is extensively known-there are dozens of strains sequenced, from some pathological to non-pathological ones, and protein complexes (map of protein complexes). In addition, it is the model organism where more metabolic studies have been done (the map of the metabolic cycles).

Thanks to the information obtained from these large-scale studies, it has been possible to obtain a list of the molecular elements of E. coli involved in its functioning. But in order to have the total plane of the living being, how it works and functions, the interactome, ie the molecular interactions between all the described elements and, in particular, between proteins.

Patrick aloy, one of the authors of the paper. "The map presented allows us to see the bacteria intimately and to design, for example, antibiotics to break up interactions between proteins or dismantle parts of their molecular machinery, or simply to understand how it works in all its complexity. This work helps us to understand how the networks that constitute and regulate the vital functions of E. coli function. " In the latter part of this study it has been possible to confirm "what was already suspected", explains Aloy, as E. coli bacteria is a good model organism and the conclusions

Are extrapolated to many other bacteria, as this study includes a comparison with the proteomes of 20 bacteria, many of which cause severe pathologies, such as those produced by Helicobacter pylori, Vibrio cholera, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitides and Yersinia pestis, As it provides useful information for biotechnological uses, to understand pathology and to design drugs, "concludes the researcher at IRB Barcelona, ​​who has several collaborative projects with the Craig Venter Institute.

Where new drug design is made to fight infections was the main objective of these studies on the molecular structure of this bacterium.

Which dwells in the intestine. Most E. coli do not cause problems. But, some types can cause disease and cause diarrhea. One of them causes traveler's diarrhea. The worst type of E. coli causes hemorrhagic diarrhea and can sometimes cause kidney failure and even death. This, in general, occurs in children and in adults with weakened immune systems.

But today, thanks to this breakthrough, we will have a better control of this and many more bacteria that have similar structure, allowing us to create effective treatments against some bacteria that cause diseases that severely attack the immune systems.

Bibliographic reference

Nature Biotechnology '